蘭州大學藥學院始建于1959年，時為蘭州醫(yī)學院藥學系。2004年11月蘭州醫(yī)學院整體并入蘭州大學，2005年6月組建成立蘭州大學藥學院。藥學學科是甘肅省重點學科，2006年獲藥學一級學科碩士學位授權(quán)，2012年設(shè)置藥物化學生物學二級學科博士點，2010年獲專業(yè)碩士學位授權(quán)。2020年藥學本科專業(yè)進入“國家級一流本科專業(yè)建設(shè)點”，2022年獲藥學一級學科博士學位授權(quán)。2023年，軟科“中國最好藥學學科”排名中，蘭州大學藥學學科在全國154所高校藥學學科中位列第23位。

學院擁有一支以中青年骨干為中堅力量的一流師資隊伍，獲得博士學位的教師占全部人數(shù)的92%，具有副高級職稱以上者占教師人數(shù)的80%。藥學院教師中近2/3的老師具有一年以上海外留學經(jīng)歷，先后建設(shè)3支省級教學科研團隊，培養(yǎng)多位省級及以上學術(shù)領(lǐng)軍人才。

學院現(xiàn)已擁有蘭州大學生物制藥國際合作基地、甘肅省2011隴藥協(xié)同創(chuàng)新中心、甘肅省健康產(chǎn)品高通量篩選與創(chuàng)制工程研究中心、甘肅省黨參產(chǎn)業(yè)工程研究中心、甘肅省中藏藥功效物質(zhì)開發(fā)與利用行業(yè)技術(shù)中心、甘肅省化學原料藥中間體行業(yè)技術(shù)中心、甘肅省黨參研究院等多個國家級及省部級重點研究基地，并與省內(nèi)外多家醫(yī)藥企業(yè)聯(lián)合建設(shè)非實體研究中心和聯(lián)合實驗室。近五年，學院教師先后主持科技部國際科技合作計劃項目、國家重點研發(fā)計劃、甘肅省重大重點項目、國家自然科學基金項目及重大橫向科研項目400余項，到賬科研經(jīng)費超過1.1億元；發(fā)表高水平學術(shù)論文500余篇；近20項科研成果實現(xiàn)轉(zhuǎn)化，項目金額3000余萬元；獲省級以上科研獎勵8項。

藥學院秉承“探藥之源，求藥之真，創(chuàng)藥之新”的院訓，發(fā)展特色鮮明、服務(wù)地方能力突出，已成為我國特別是西部地區(qū)藥學人才培養(yǎng)和科學研究的重要基地。